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真菌一般是不能自愈的，需要采取治疗措施。首先要将隔离饲养，然后每天在患处涂抹抗真菌的药膏，再配合干养。
一般来说，真菌初期，就是龟甲上只有少量的斑点状真菌的情况，对的主要影响就是丑。但是如果发展到后期，龟甲大面积真菌，就不仅仅只是影响的美观性了，同时也会影响龟甲呼吸，进而导致甲壳感染腐甲等问题。因为真菌问题，也可能会导致无法顺利换甲的情况。所以真菌这件事，还是要重视起来的。龟的真菌感染一般是不能自愈的，主人需要对龟采取适当的治疗措施。
1、发现真菌感染的要立即隔离饲养，不然会传染其他健康龟，水龟或半水龟建议干养治疗。首先，隔离饲养的环境应该保证通风、日晒和干燥。建议使用聚维酮碘、达克宁等药物，这类药物对细菌、真菌、病毒等都有疗效。
2、治疗时每天于患处涂抹抗真菌类膏，比如盐酸特比萘芬软膏。此药是抗真菌感染十分有效的非外方药，这种药营可以使真菌感染的皮肤表层脱落，进而导致真菌的脱落。然后再配合干养，细心观察，发现因活动弄掉药物及时再给涂上，观察病症时轻拿轻放。
3、每天给泡澡2-3次，每次20分钟左右，用5%的聚维酮础溶液溶干水中，药跟水的比例为1.5：1，用药水浸泡的目的是在泡澡时会喝入有药的水，达到治疗的效果。
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