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导致番茄裂果的原因主要有三个，一个是品种选择不当，二是温度调控不科学，三是花器养分供应不足，尤其是缺少硼肥和钙肥。
品种选择不当是番茄裂果的主要原因，一般来说，番茄中果实大，果皮薄的圆形品种更容易裂果，如果选择种植了这类品种，外加养护不当，就容易出现大量裂果的情况。所以在种植番茄的时候，一定要选择合适的品种。
在种植番茄的时候，在花芽分化期间如果温度调控不合理，就容易孕育出花蕊开裂的畸形花。这种花卉结出的果实多是畸形果。在番茄生长的过程中，应该注意对温度的控制。
硼是番茄生长过程中必不可少的元素，它可以促进果实生长，还可以促进细胞分裂和果胶的形成。而番茄如果一旦缺硼就容易导致裂果情况出现，而缺硼大多是由于硼肥施用不足导致的。而如果养护温度过低或是氮钾肥的使用过多会影响根系对钙的吸收，番茄如果缺钙也会导致它裂果。
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