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黑线仓鼠喜欢筑巢，行动缓慢，运动I时腹部着地。雌鼠的力气比雄鼠大且好色，雄鼠的睾丸比较大长13毫米左右。黑线仓鼠成年后的体长约在80～120mm之间，成年后的体重约在28～40克之间。
黑线仓鼠体肥壮，吻钝，耳圆。尾短.约为体长的l/4。具颊囊。乳头4对。
体背中央白头顶至尾基部有一暗色条纹，其明显程度各亚种间有区别。东北区各亚种毛色比较深暗，背纹黑而宽;华北种群毛色略浅，背纹黑而较细;西部荒漠草原种群的毛色则较浅，背纹极不明显。尾部背面黄褐色，腹面污白色。耳的内外侧披短毛，但有一很窄的白色边缘。
胸部、腹部、四肢内侧与足背部的毛均为白色或污白色，与体背毛色界线明显。除足背面以外，毛基均为灰色。
头颅圆形，听泡隆起。颧弓不甚外凸，左右近平行。鼻骨窄，前部略膨大，后部较凹，无明显眶上嵴。
上门齿细长，上臼齿3枚，M1咀嚼面上有2纵列6个齿突，M2具4个齿突，M 3也有4个齿突，但排列不规则。下臼齿M1的咀嚼面有3对齿突，M2、M3均有4个齿突。
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