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一、叶片区别
黄菖蒲叶片为灰绿色，呈宽剑形，长约40-60厘米，宽约1.5-3厘米，顶端为渐尖，基部为鞘状，颜色较淡，中脉很明显。而菖蒲叶片为绿色，呈剑状线形，比前者宽大许多，长约90-100厘米，宽约1-2厘米，基部较宽，对折。
二、花的区别
黄菖蒲花的颜色为黄色，外花被裂片为卵圆形或者倒卵形，且有黑色条纹，长约7厘米，宽4.5-5厘米，内花被裂片为倒披针形，要小些，约2.7厘米。花期在每年的5月份。而菖蒲花的颜色为黄绿色，肉穗花序呈狭锥状圆柱形，花被片相对前者要小的多，约2.5毫米。花期为6-9月。
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