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不同属性
萱草是一种多年生草本植物，主要种植在绿地园艺中，是许多人喜爱的观赏花，品种达数百个品种，黄花菜是其中之一，并且只有黄花菜才能食用，所这也是黄花菜与萱草的不同之处。
不同叶形
黄花菜是很多人都喜欢的传统蔬菜，它的花蕾细长，花枝粗细不一，枝叶的下部都是相互重叠的，而且长度为30～60cm左右，而萱草的花柄很长，叶子相对于黄花菜会较宽一点，主要呈现为披针形，这也是两者最大的区别。
不同花形
黄花菜是一种肉质的根植物，在花开花时花枝长度不同，而花很多，花色有浅黄色、桔红色等多种颜色，而萱草花柄很长，花色主要是桔黄色，形状像百合，在开花期很美。
不同果实
黄花菜和萱草果实不同，一般黄花菜植株较高，茎下端逐渐膨大，成熟时果实呈椭圆形，颜色以黑色为主，萱草果实具小刺，多数在许多地方栽培。
不同碱含量
一般的新鲜黄花菜的秋水仙碱含量会很少，用以制成干货，或者高温炒熟的影响下，植株里面的碱含量会大大降低甚至会消失不见，但是萱草中含有大量的秋水仙碱含量，即使高温煮熟也不会消失，也不能直接食用，带有一定的毒性。
不同果期
萱草是很多都盆栽，因为形状类似百合花，一直深受很多人的喜爱，而且萱草还是中国的母亲花，花果期一般是在每年的6～7月份，黄花菜的花果期是在5～9月份，所以黄花菜和萱草是完全不同的。
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